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ceRNA网络概念及调控机制简介
ceRNA全称competing endogenouse RNA, 中文叫做竞争性内源RNA。和ncRNA等概念不同,ceRNA并不是代表某种特定类型的RNA,而是一种调控机制。在ceRNA的概念中有两个关键词,竞争和内源,内源指的是这个调控机制本来在生物体内就存在,而竞争就是这个调控机制的核心。miRNA可以和靶标mRNA结合,抑制其翻译或者导...
TAGS: CEnna 阅读:9768次 发表于:2022-07-02
科研干货 | 一文看懂ceRNA的研究方法
ceRNA包括编码蛋白的mRNA、长链非编码RNA(lncRNA)、假基因转录本以及环状RNA等。该假说通过生物信息学、细胞生物学等实验得到验证,揭示了全新的转录组调控网络。ceRNA的特点包括存在相同的miRNA结合位点,都受miRNA调控,以及ceRNA之间存在相互调控关系,表达水平变化趋势一致。研究ceRNA的方法包括确定研究对象...
TAGS: CEnna 阅读:9768次 发表于:2024-11-09
ceRNA:一种全新的基因表达调控模式
ceRNA的研究意义深远,它为理解生理与病理条件下生物学现象提供了新视角,如在脑胶质瘤、甲状腺癌、黑色素瘤等疾病中,关键抑癌基因PTEN的低表达与特定ceRNA(如PTEN假基因、VAPA、BCL11B等)调控失衡密切相关。随着ceRNA假说的提出,越来越多的科研工作开始关注这一调控网络在生物学功能中的重要作用。ceRNA...
TAGS: CEnna 阅读:9768次 发表于:2024-08-23
ceRNA机制研究常见套路
近年来,研究ceRNA机制的文献数量显著增加,发表量高达4500篇以上,且趋势持续上升。医学科学部国自然基金项目对ceRNA机制的研究资助高达11000多万,表明研究热度不减。在研究方向上,lncRNA与circRNA参与ceRNA机制调控的研究占主导,且这一机制在神经、肌肉、心血管、脂肪、造血、免疫系统等众多疾病中得到探索。
TAGS: CEnna 阅读:9768次 发表于:2024-10-22
研究ceRNA,五步就够了!
第一步:质疑BRAFP1是否为ceRNA?已有研究为这一思考铺垫了基础。第二步:验证BRAFP1与BRAF是否形成ceRNA关系?研究团队通过构建Dicer酶完整和缺失的模型,发现只有在Dicer酶完整的细胞中,Braf-rs1、B-Raf表达与BRAFP1和BRAF表达的正相关性才存在,从而证实了两者间ceRNA关系。第三步:探讨正相关性是否由...
TAGS: CEnna 阅读:9768次 发表于:2024-11-16
抗癌药物ceRNA
研究展示了药物敏感性相关ceRNA的全面表征,构建了涵盖多种抗癌药物的ceRNA网络,识别了一个与患者生存和癌症分期紧密相关的交叉网络(ICN)。材料与方法部分利用了多种生物学数据库和工具,包括miRanda,RNAhybrid,TargetScan,PITA等,以确保ceRNA构建的准确性和有效性。研究结果分为五个部分:第一部分详细...
TAGS: CEnna 阅读:9768次 发表于:2024-10-31
这是什么新套路?肿瘤亚型+ceRNA调控网络+肿瘤预后,简单验证就能发5分+!
这种类型的lncRNA被称为ceRNA,由miRNA介导的基因之间的广泛相互作用被称为ceRNA网络。ceRNA调控网络的形成机制是这样的:由于同样的响应元件可以存在于许多不同的lncRNA和靶基因中,形成的ceRNA调控网络非常庞大,近60%的编码基因受到这种相互作用的调控。一些研究显示ceRNA网络可能与肿瘤微环境中的免疫细胞...
TAGS: CEnna 阅读:9768次 发表于:2024-11-04
文献精读{ceRNA+肺癌}I:什么是ceRNA
简单来说,它是一种竞争性内源RNA(Competing Endogenous RNA,ceRNA),其核心特性在于共享miRNA响应元件(miRNA response elements,MREs)。这种共享机制使得ceRNA能够与miRNA进行竞争性结合,从而减弱miRNA对靶基因mRNA的抑制作用,直接提升蛋白质的表达水平。在ceRNA家族中,包括了多种类型:编码mRNA(作为信...
TAGS: CEnna 阅读:9768次 发表于:2024-04-07